中药材价格不稳定。受市场供需关系、游资炒作及人力成本增加的影响，中药材价格存在较大的不稳定性。2010年-2014年我国中药材出口价格年均增长20.1%，在经过5年价格飙涨之后的，中药材“药你命”的非理性时代结束，中药材价格走低是2015年的主旋律。2015年我国中药材出口平均价格43.9元/公斤，较去年同期下降4.7%。2014年之前价格大涨的趋势、充斥的游资哄抬价格使很多药农看好中药材行情，纷纷扩大种植面积，积极生产，然而随着游资的撤离，中药材市场充足的供给，导致今年中药材价格普遍降低。
面临中医崛起国家的倒逼压力。近年来，我国中药材出口占国际市场的份额不断降低，2015年我国中药材出口占国际市场总额的2%[3]，不及日本韩国。与此同时周边国家的中医产业发展迅速，如日本、韩国、印度、泰国，我国中医产业发展面临倒逼压力。
贸易壁垒频出，出口门槛渐高。目前，技术贸易壁垒已成为我国中药材出口的最大“障碍”。不仅日本、韩国等亚洲地区近来频频更新进口药材限量要求，欧盟国家对中药材的准入更是设置了各种认证及注册制度，国外针对中药材的技术壁垒主要集中在各种注册、认证程序、重金属、农药残留和微生物限量方面，而我国的中药材生产及加工方式都较为传统，很多环节达不到发达国家制定的标准，对出口造成了极为不利的影响。
