农业农村问题，依然是“十三五”规划的重要部分。其中，增强粮食安全保障能力是国家一直强调的内容。过去11年，我国粮食生产实现了11连增，农业发展取得了巨大成就。
但是，粮食增产背后，是一些地方以牺牲环境为代价的增产。未来，生态环境保护与粮食生产的各种支撑要素的可持续性，将给中国农业发展，尤其是粮食生产带来巨大压力。
“十二五”规划里面也强调了生态农业，提出“完善现代农业产业体系，发展高产、优质、高效、生态、安全农业”。如今，农业生产与生态环境保护之间矛盾越来越突出。这样的现实更加警醒我们，生态农业建设发展这一理念应该上升为“国家战略”。
目前，我国速效化肥产量排在世界首位，速效化肥的年使用量已经达到5100多万吨（纯量），占全世界消费总量的30％以上，单位耕地面积施肥量已达到世界平均水平的3倍。中国科学院南京土壤研究所的研究结果表明，每年我国有123.5万吨氮通过地表水径流到江河湖泊，49.4万吨氮进入地下水，299万吨氮进入大气。这些氮素造成严重的农业面源污染、水体富营养化、土壤板结等现象，同时通过反硝化作用还向大气释放出一氧化二氮等温室气体，造成温室效应。
